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基因数据处理52之cs-bwamem集群版运行(1千万条100bp的reads)

发布时间:2021-03-08 11:03:14 所属栏目:大数据 来源:网络整理
导读:1.art生成模拟序列: art_illumina -ss HS20 -i GRCH38BWAindex/GRCH38chr1L3556522 . fna -l 100 -c 10000000 -o g38L100c10000000Nhs20 2.上传到hdfs,制定partition数 spark-submit --class cs .ucla .edu .bwaspark .BWAMEMSpark --master spark://maste

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